Филипинската независима църква, испанската Iglesia Filipina Independiente, наричана още Aglipayan Church, независима църква, организирана през 1902 г. след филипинската революция от 1896–98 г. в знак на протест срещу контрола на испанското духовенство над Римокатолическата църква. Съоснователи на църквата бяха Исабело де лос Рейес и Флорентино, автор, трудов лидер и сенатор, който бе хвърлен в затвора по време на революцията заради критиките си към испанското духовенство и правителствени служители във Филипините, и Грегорио Аглипай Лабаян, филипински римокатолически свещеник който е отлъчен през 1899 г. за дейността си от името на революцията. Аглипай прие молбата на де лос Рейес да бъде върховен епископ на новата църква през 1903 г., длъжност, която заемаше до смъртта си през 1940 година.
Църквата продължи да следва римокатолическите форми на поклонение, но в продължение на много години учението беше силно повлияно от унитарианството. През 1946 г. се разрази разкол и от църквата напусна унитарианска фракция. При Изабело де лос Рейес-младши, избран за епископ през 1946 г., църквата приема през 1947 г. нова декларация за вяра и религиозни артикули, които са тринитарни. Протестантската епископска църква в САЩ освети три епископа на Филипинската независима църква през 1948 г. и двете църкви влязоха в тясно сдружение. През 1961 г. църквата е приета в пълно общение с Английската църква и старите католически църкви.
В края на 20 век членството е 1 400 000.
