Чуждестранни пътувания и промяна на стила.
В края на 18 век Фишер е в разгара на кариерата си. Като видим знак за успеха му като придворен архитект той е издигнат до благородството през 1696 г. Имперският съюз с Прусия, Холандия и Англия по време на войната за испанската наследство дава възможност на Фишер през 1704 г. да посети тези страни и да изучават архитектурата им, по-специално във връзка с Паладио. Резултатът беше забележителна промяна в архитектурния му стил. През 1707 г. той заминава за Венеция, за да изучава паладианската архитектура при нейния извор. Резултатът беше неговото разработване на нов тип фасада на двореца „Паладий“, класическа в своите пропорции, но оживена с богато изваяна украса. Състои се от централна проекция, подчертана от гигантски ред и превъзходена от триъгълен фронтон и от сравнително неартикулирани странични секции. Моделите му бяха английски и северногермански барокови интерпретации на паладианската архитектура, както и произведенията на самия Паладио и на неговите италиански последователи. Основните постижения на Фишер в тази област са фасадите на бохемската канцелария (1708–14) и двореца Траутсън (1710–16), както във Виена, така и на двореца Клам-Галас (началото на 1713 г.), в Прага, които бяха имитирани от архитекти в цялата империя на Хабсбургите.
През първите 10 години на 18 век обаче Фишер проектира по-малко сгради, отколкото в годините преди. Времето му беше заето от административните му задължения като главен инспектор на съдебните сгради и работата му по голяма история на архитектурата, Entwurf einer historischen Architektur. Книгата му, която разкрива широкия обхват на неговото учене, беше първата сравнителна история на архитектурата на всички времена и всички нации; тя включва значителни екземпляри от египетска, персийска, гръцка, римска, мюсюлманска, индийска и китайска архитектура, илюстрирана с гравюри с обяснителни бележки. Някои от археологическите реконструкции, които се появяват в книгата, са сред най-добрите от времето на Фишер. В края на историческото изследване той поставя свои собствени постижения, които той вижда като логично продължение на римската традиция в архитектурата. Книгата е публикувана през 1721г.
Окончателни проекти.
Когато през 1711 г. умира вторият им императорски покровител Йосиф I, позицията на Фишер като главен архитект на виенския двор вече не е оспорена. Мнозина предпочетоха по-приятната и не толкова взискателна архитектура на своя съперник Йохан Лукас фон Хилдебранд пред високите концепции на Фишер. И въпреки това той успя да спечели благоразположението на Чарлз VI, на когото посвещава историята на архитектурата в ръкопис през 1712 г., и да получи комисионната за изграждането на Карлскирхе (църква "Св. Чарлз Борромео"; започна 1715 г.).
Чарлз се закле да построи Карлскирхе като принос на своя покровител за спасението на града от епидемия от чума. В своето имперско величие сградата Фишер е замислила не само прославен св. Чарлз, но е била и паметник на самия император. В тази църква той се опита да включи и хармонизира основните идеи, съдържащи се в най-важните свещени сгради от миналото и настоящето, започвайки от Храма на Йерусалим и включително Пантеона и Свети Петър в Рим, Света София в Истанбул, а също и Dôme des Invalides в Париж и St. St.'s в Лондон. Сравнително независимите части на сградата - чифт римски триумфални колони, ниски кули, висок овален купол, централен портик, моделиран след фасада на римски храм, трансепт и презвитер - са хармонизирани, за да формират визуално единство от каквато и точка да са те. виждал. Сложната формална и символична структура на сградата е резултат от нейната двойна функция. Например, най-поразителната черта на църквата - двойката гигантски триумфални колони от двете страни на портика - е украсена със спираловидни релефи, прославящи живота на Свети Чарлз. Двойката колони обаче говори и за емблемата на императора, „херкулесовите стълбове“.
Фишер не доживял, за да види шедьовъра си завършен, но синът му Йосиф Емануел Фишер фон Ерлах завършил църквата с някои промени. Йосиф Емануил също довърши Императорските конюшни (1719–23) и построи по проекти на баща си Императорската библиотека (проектирана 1716 г., построена 1723–37 г.), вътрешността на която беше най-внушителната библиотечна зала на своето време.
