Оценка на растенията
Оценката на стойността на растенията, така че селекционерът да може да реши кои индивиди трябва да бъдат изхвърлени и на когото е разрешено да произвеждат следващото поколение, е много по-трудна задача с някои характеристики, отколкото с други.
Качествени герои
Най-лесните герои или черти за справяне са тези, включващи прекъсващи или качествени разлики, които се управляват от един или няколко основни гена. Има много такива наследствени различия и те често имат дълбоки ефекти върху растителната стойност и използването. Примери са нишестени спрямо захарни ядки (характерни съответно за полска и сладка царевица) и детерминантен спрямо неопределен навик за растеж на зелен фасул (определящите сортове са адаптирани към механично събиране). Такива разлики могат да се видят лесно и да се оценят бързо, а изразът на чертите остава същият, независимо от средата, в която расте растението. Характеристики от този тип се наричат силно наследствени.
Количествени знаци
В други случаи обаче характеристиките на растенията постепенно преминават от една крайност в друга в непрекъсната серия и класифицирането в дискретни класове не е възможно. Такава променливост се нарича количествена. Много черти от икономическо значение са от този тип; например височина, толерантност към студ и суша, време до узряване и по-специално добив. Тези черти се управляват от много гени, всеки от които има малък ефект. Въпреки че разграничението между двата типа черти не е абсолютно, все пак е удобно да се определят качествени знаци като такива, включващи дискретни разлики и количествени знаци като такива, включващи степенувана поредица.
Количествените знаци са много по-трудни за контролиране на селекционера поради три основни причини: (1) чистият брой на участващите гени прави наследствената промяна бавна и трудна за оценка; (2) измененията на включените черти обикновено се откриват само чрез измерване и задълбочени статистически анализи; и (3) повечето вариации се дължат на околната среда, а не на генетичната обремененост; например, наследствеността на определени черти е по-малка от 5 процента, което означава, че 5 процента от наблюдаваната промяна се причинява от гени, а 95 процента - от влиянието на околната среда.
От това следва, че са необходими внимателно проектирани експерименти, за да се разграничат растенията, които са по-висши, защото носят желани гени от тези, които са по-добри, защото те се развиват в благоприятно място.
