Борбата за освобождение в Танганьика бе водена от Африканския национален съюз Танганийка, чието знаме представляваше хоризонтален трикольор от зелено-черно-зелено. Изборите потвърдиха огромната подкрепа на обществото за организацията и британските власти предложиха промяна на партийния флаг за използване като национален флаг след независимостта на 9 декември 1961 г. По това време бяха добавени жълти фимбрации.
При арабското управление Занзибар отдавна лети червено знаме, но на 12 януари 1964 г. на власт дойде черен африкански режим под знаме на черно, жълто и синьо. На следващия месец управляващата партия Афро-Ширази въведе ново национално знаме, подобно на своето. Хоризонталните синьо-черно-зелени ивици стояха съответно за морето, хората и сушата, докато тясна бяла вертикална ивица на подемника беше за мир.
През април 1964 г. страните Танганьика и Занзибар се обединиха, а в началото на юли традициите на знамето им бяха смесени, за да се създаде новото национално знаме на Танзания. Цветовете на знамето бяха включени по диагонал за отличителност. Мнозинството от населението на страната се символизира от черната ивица, докато зеленото подсказва за богатите земеделски ресурси на земята. Минералното богатство се отразява в тесните жълти граници, докато Индийският океан е символизиран от синьо. След като Zanzibar се обедини с Tanganyika, флагът на Zanzibar въпреки това продължава да се използва локално на тези острови.
