Африканската партия за независимост на Гвинея и Кабо Верде (PAIGC) намери готова подкрепа в тези португалски колонии за посланието си за социално и икономическо развитие чрез политическа революция. През 1961 г. тя прие знаме, донякъде подобно на това на съседните независими държави Гвинея и Гана, които след това обсъждаха бъдеща федерация на западноафриканските земи. Към пан-африканския си червено-жълто-зелен, освободителното движение за Гвинея-Бисау добави черна звезда на лентата на подемника. Тази ивица и звезда съответствала географски на западния крайбрежен регион със столицата му Бисау (от която произлиза националното име). Хоризонталните ивици в останалата част на знамето и техните жълти и зелени цветове приблизително съответстваха на саваните на север и горите на юг.
Официално се казваше, че черната звезда е символ на ръководството на PAIGC, нейният цвят се отнася до африканския народ и тяхната решителност да живеят в достойнство, свобода и мир. Жълтото се тълкува като символ на реколтата и плодовете на работата, както в селското стопанство, така и по друг начин. Грийн припомни огромните джунгли и земеделските земи, които осигуряват поминък на огромното мнозинство от гражданите. Партийният флаг включва и инициалите PAIGC, пропуснати при обявяването на независимостта на 24 септември 1973 г. Португалия не признава Гвинея-Бисау или нейното знаме чак след собствената си революция през 1974 г.; въпреки това голяма част от Гвинея Бисау вече беше под контрол на PAIGC и неговия флаг. Кабо Верде в крайна сметка изостави марксистката политика на PAIGC и промени националния си флаг, но Гвинея-Бисау запазва първоначалния си дизайн.
