Преди Косово да обяви независимост на 17 февруари 2008 г., тя никога не е имала политическия статут, който да му позволи да бъде свое знаме. След Втората световна война Косово е включено в социалистическа Югославия като автономен регион (по-късно автономна провинция) на република Сърбия. Федералното правителство разрешава флагове само за няколко конституционни югославски републики. Въпреки това етническите албанци, живеещи в Косово, в крайна сметка бяха позволени да летят на албанския флаг.
Косово остана част от Сърбия след разпадането на социалистическа Югославия в началото на 90-те години, но сепаратисткото движение в провинцията набира сила през цялото десетилетие. През 1998 г. Сърбия предприе наказателни действия срещу сепаратистите в Косово, които през 1999 г. бяха противодействани от Организацията на Северноатлантическия договор (НАТО). Косово беше поставено под администрацията на Организацията на обединените нации, която остана там след провъзгласяването на независимостта на Косово през 2008 г., докато до голяма степен бе заменена през 2009 г. от служители на Европейския съюз (ЕС). Сърбия и голям брой други страни останаха против тази декларация за независимост.
Проведе се официално състезание за избор на национален флаг за Косово. Голяма част от записите бяха базирани на дизайна на албанския флаг, пряко или косвено. Избраният модел - повлиян от знамето на ЕС - направи ясно изявление, подчертавайки Косово като мултиетническа страна. Синият и жълтият цвят на знамето на ЕС бяха използвани за съответния фон и силуета на националната територия, а кръгът на белите звезди на знамето на ЕС беше успореден в дъгата на бели звезди на знамето на Косово. За звездите се казваше, че стоят за шестте преобладаващи етнически групи на страната (албанци, бошняци, горани, роми, сърби и турци). Въпреки това етническите албански и сръбски жители в Косово продължиха да използват съответните си национални знамена.
