Като част от администрираната от Съединените щати доверителна територия на Тихоокеанските острови (TTPI), Палау беше под знамената на Организацията на обединените нации, САЩ и доверителната територия. Местното желание за отделна държава и правителство се реализира на 1 януари 1981 г. и по този повод се повдига флаг на Палауан. През 1979 г. се проведе конкурс, който доведе до над хиляда предложения; избраният е създаден от Blau Skebong и е одобрен от новото правителство на 22 октомври 1980 г. Този флаг се използва и до днес.
Златният диск представлява луната, която има специално значение за Палауанската култура. Пълнолунието традиционно се счита за най-доброто време за риболов, засаждане и други дейности. Казва се, че дава на местните хора „усещане за топлина, спокойствие, мир, любов и домашно единство“. Фонът на знамето не е, както може да се очаква, символ на Тихия океан; по-скоро се отнася до „окончателното преминаване на чуждестранния администриращ орган от нашата земя“. Пълна независимост е постигната от Палау чак през октомври 1994 г., но по това време в знамето не се правят промени. Оригиналният флаг от 1981 г. е запазен в музея Палау в столицата Корор. Знамето на Палаун е подобно по дизайн на знамето на Бангладеш, но двете имат различни цветове и символи.
