Водещият традиционен символ на Бурунди бил древен барабан, Кариенда, който имал статус на полудивина. Самият муми („владетел“) би могъл да интерпретира посланията на Кариенда и да ги трансформира в правила, управляващи обществото. По този начин Кариенда беше избрана за символ на националния флаг, когато Бурунди излезе от белгийското колониално управление. Беше показано и растение от сорго, представляващо основен селскостопански продукт на Бурунди. Барабанът и растението се появяват на централния бял диск на знамето, разрешено от mwami на 30 март 1962 г., и се повдигат на 1 юли, когато е постигната независимост.
Фонът на знамето включваше бяло сатира, идея за дизайн, която може би е заимствана от Белгия (Испанска Холандия), чийто кръст на Бургундия е общ мотив на знамето от 17-ти век. Белият цвят на сатира и централния диск символизираше мир. Останалите райони бяха червени, за борбата за независимост и страданията на нацията, и зелени, за надеждите, които се полагат на бъдещото развитие. След свалянето на монархията през ноември 1966 г. Кариенда е отстранена от знамето. Нов дизайн, последно потвърден с указ от 27 септември 1982 г., става официален на 28 юни 1967 г. Трите шест-остри звезди в червено със зелени рамки съответстват на националното мото: „Единство, работа, прогрес“. За мнозина обаче несъмнено си спомнят трите основни етнически групи на Бурунди - Туци, Хуту и Тва - и лоялността, която някога Бурунди са обещали на своя бог, цар и страна.
